计算化学中软件的应用.ppt

计算化学中 常用软件的简单介绍,1,工程,数学,计算机科学,化学,,狭义：量子化学,广义：计算化学是一门涉及多种学科的边缘学科,,计算化学,什么是计算化学？,2,3,计算过程,5计算结果的分析和整理,1文献调研,2 确定计算目的,3 计算模型的构造,4 计算方法的选取,4,计算化学所需的条件,5,GaussView 的简单介绍,GaussView是一个专门设计与高斯配套使用的软件其主要用途有两个:构建高斯的输入文件和 以图的形式显示高斯计算的结果 6,特点：,通过计算机进行图形绘制和空间分子模拟，能给人增加真实感7,8,GaussView基本功能的演示,9,如何使用UE编辑作业： 以丙氨酸为例,UltraEdit 是一套功能强大的文本编辑器,10,Gaussian作业的格式：以丙氨酸为例,,,,,,作业名称，运行内存，运行核数,计算执行路径行，包括方法, 基组,任务类型,title部分，标识和说明作用,分子说明部分,,,电荷和自旋多重度,11,Route Section（计算执行路径行）,Route Section主要由方法，基组，任务类型三部分组成,1.方法的选择,12,2.基组的选择,13,intrinsic reaction coordinate内禀反应坐标,3.Gaussian程序能完成的任务类型,,14,Gaussian 09 的简单介绍,程序界面,,,点击此处即可上传作业,15,分子说明 部分,电荷与 多重度,标题行,计算执行 路径,返回主单 并运行,返回主菜单,保存,放弃任务,检查计算 执行路径,,,,,,,,,,Gaussian09 上传作业界面,16,举例,1.分子轨道 2.原子电荷,17,1.如何查看分子轨道？,在UE中编辑输入文件时需要在计算执行路径行加 pop=full 关键词,1，3 丁二烯,注意：计算结束后，输入命令 formchk xxx.chk xxx.fchk ，再用GaussieView打开fchk文件,18,,,19,1，3 丁二烯HOMO轨道,,,20,1，3 丁二烯LUMO轨道,21,Isatins,猜想：如果此物质要和金 属配位，应该首会和哪个位点配位呢？,,,,,,,,2.如何查看原子电荷?,在UE中编辑输入文件时需要在计算执行路径行加 pop=nbo 关键词（即NBO电荷分析）,22,,,23,24,,实验给现象，理论供解释！,25,谢谢大家！,26,。